清晨的阳光刚爬上窗台，陆沉舟就被一阵“汪汪”乱叫惊醒。揉着惺忪睡眼推开房门，眼前景象让他差点跌坐在地——三只小狗不知何时挣脱狗窝，正叼着小宝的袜子、小糖的围兜在院子里“拔河”，大宝的作业本散落一地，被啃得满是齿痕。
“小祖宗们！”陆沉舟手忙脚乱去抢救作业本，却被“闪电”咬住裤腿往后拽。这时小宝顶着鸡窝头冲出来，手里举着用树枝做的“权杖”：“都给本女王停下！”她的呵斥不仅没起作用，反而让小狗们更兴奋，“星星”跳起来扑向她的裙摆，害她摔了个屁股墩。
小糖摇摇晃晃跑过来，手里攥着块咬了一半的馒头。她刚蹲下要喂狗，“棉花糖”突然竖起耳朵，冲着院门外狂吠不止。众人循声望去，只见一个戴着宽檐帽、裹着黑色围巾的身影一闪而过，只留下雪地上一串奇怪的脚印——那脚印看起来既不像人的，也不像动物的。
“是偷狗贼！”小宝抄起弹弓就要追，被陆沉舟一把拉住。他蹲下身查看脚印，眉头越皱越紧。这些脚印边缘模糊，仿佛是某种软质物体留下的，而且脚印间距忽大忽小，像是刻意伪装。“别轻举妄动。”陆沉舟神色凝重，“这人不简单。”
当天夜里，月光透过窗户洒进屋子。小宝和小糖坚持要和小狗睡在一起，说是要“守护它们”。两人刚睡着，“棉花糖”突然发出低沉的呜咽，爪子不停扒拉窗户。小宝迷迷糊糊睁开眼，借着月光看见院墙上有个黑影正探头探脑。
“抓小偷！”小宝抄起枕头砸过去，黑影慌忙跳下墙，却遗落了一个布包。陆沉舟闻声赶来，打开布包发现里面竟是几张泛黄的报纸，报纸上用红笔圈着几则新闻——全是关于邻县流浪狗失踪的报道，最近的一则新闻照片里，有只小狗和“闪电”长得极为相似。
“这些狗果然有问题。”陆沉舟喃喃自语。大宝举着放大镜凑过来：“爸，你看报纸边缘的指纹，和院子里的脚印形状好像！”话音未落，小糖突然“哇”地大哭起来，原来“星星”不知何时叼走了她最心爱的小熊玩偶，正躲在角落里撕咬。
为了找出真相，陆沉舟决定带着小狗去邻县一探究竟。小宝和小糖自然要同行，两人把小狗打扮得“花枝招展”——“闪电”戴着用易拉罐做的头盔，“星星”系着小宝的红领巾，“棉花糖”穿着小糖的旧裙子。一路上，小狗们把车厢弄得乱七八糟，还把陆沉舟的地图啃成了碎片。
到了邻县，他们西处打听，终于在城郊的废弃工厂附近发现了线索。工厂大门紧闭，围墙上方布满铁丝网，隐约传来阵阵狗叫声。小宝趴在门缝往里看，突然脸色大变：“里面有好多小狗！和我们家的长得好像！”
就在这时，一阵阴风吹过，那个神秘人再次出现。他缓缓摘下帽子，露出一张布满伤疤的脸，眼神冰冷如刀。“把狗交出来。”他的声音沙哑低沉，仿佛来自地狱。小宝立刻把“棉花糖”护在身后：“休想！它们是我们的家人！”
神秘人冷笑一声，从怀里掏出一把寒光闪闪的匕首。千钧一发之际，“闪电”突然冲上前，一口咬住神秘人的裤腿。神秘人吃痛，匕首掉在地上。陆沉舟趁机扑过去，两人扭打在一起。混乱中，小宝带着小糖和小狗们躲进了旁边的草丛。
“怎么办？”小宝急得首掉眼泪。小糖突然指着草丛深处，奶声奶气地说：“洞，洞！”原来草丛里有个隐蔽的洞口，里面传来微弱的狗叫声。小宝咬咬牙，带着小糖钻了进去……等待他们的，究竟是怎样的秘密？而那个神秘人，又和这些小狗有着什么不可告人的关系？
